1）昆虫、杂草检疫重点实验室所配置用于形态学鉴定的显微镜包括光学显微镜、扫描电镜（必要时配置）这一关键仪器要求达到国际一流水平。
（2）植物病原真菌和线虫检疫重点实验室所配置的用于形态学鉴定的显微镜，包括光学显微镜和扫描电镜（必要时配置）；用于病原物培养的光照培养箱；用于致病性测定的人工气候箱；用于病原菌保存的超低温冰箱或菌种保存箱；和用于分子生物学检测的PCR仪、定量PCR仪、芯片扫描检测仪等关键仪器设备要求达到国际一流水平。
（3）植物病毒检疫重点实验室所配置的用于植物病毒提取的高速离心机、超速离心机；用于病毒形态学观察的透射电镜（必要时配置）；用于血清学检测的酶标仪、洗板机和用于分子生物学检测的主要仪器设备：PCR仪、定量PCR仪、芯片扫描仪等关键仪器设备要求达到国际一流水平。
（4）植物病原细菌检疫重点实验室所配置的用于病原物分离培养的光照培养箱或人工气候箱；用于病原菌保存的冰箱、超低温冰箱或菌种保存箱；用于细菌生化检测的微生物自动分析仪和用于分子生物学检测的PCR仪、定量PCR仪、芯片扫描检测仪等关键仪器设备均要求达到国际一流水平。
（5）转基因产品检测重点实验室所配置的用于分子生物学检测的关键仪器设备：PCR仪、定量PCR仪、基因芯片扫描仪、紫外分光光度计等要求达到国际一流水平。
（6）检疫处理重点实验室所配置的用于物理处理、化学处理等关键仪器：要求达到国际一流水平。
（7）按照产品进行分类的重点实验室和隔离检疫重点实验室该类实验室包括：玉米、豆类、麦类、林木、花卉、烟草、蔬菜种子、种苗、水果、草坪种子等实验室以及隔离实验室，该类实验室检测的有害生物复杂，有的包括几乎所有有害生物如真菌、细菌、病毒、细菌、线虫、昆虫、杂草等，有的仅是其中几类有害生物，该类实验室应根据所检测产品上的主要有害生物种类情况参照上述各类有害生物检疫重点实验室的要求进行有选择的配置。